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Comptabilité – comparatif Suisse

Logiciels de comptabilité pour PME suisses : TVA, QR-facture et connexion bancaire comparées.

Le top 3 en Suisse en un coup d'œil

RangSolutionScorePrix
1bexio100Excellentdès CHF 35 / mois
2KLARA100Excellentdès CHF 55 / mois
3Abacus86Très bienPrix selon l'ampleur du projet, offre via partenaire
26 solutions
  • bexio

    Logiciel cloud pour comptabilité, factures, salaires et contacts, conçu pour les PME suisses.

    Idéal pour : Indépendants et PME, forfaits de 1 à 25 utilisateurs

    100Excellentdès CHF 35 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBill✓ Oui
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • KLARA

    Logiciel de gestion suisse avec comptabilité, salaires, caisse et app, hébergé en Suisse.

    Idéal pour : Indépendants et petites PME

    100Excellentdès CHF 55 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBill✓ Oui
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Abacus

    Logiciel de gestion suisse complet (finances, salaires, saisie du temps, etc.), mis en place via des partenaires certifiés.

    Idéal pour : PME en croissance et entreprises avec fiduciaire

    86Très bienPrix selon l'ampleur du projet, offre via partenaire
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBill✓ Oui
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Blond.swiss

    Logiciel cloud suisse avec gestion clients et comptabilité.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    86Très biendès CHF 25 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Infinity

    Comptabilité cloud qui propose des écritures à partir des comptes bancaires connectés et lit automatiquement les justificatifs.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    86Très biendès CHF 24 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Magic Heidi

    App suisse pour indépendants avec factures et comptabilité simplifiée, sur mobile et ordinateur.

    Idéal pour : Indépendants

    86Très biendès CHF 0 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Run my Accounts

    Comptabilité en tant que service : logiciel et équipe qui s'occupe des écritures, de la TVA et des paiements.

    Idéal pour : PME qui veulent externaliser leur comptabilité

    86Très biendès CHF 0 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Swiss21

    Logiciel de gestion du groupe Abacus pour le bureau numérique, avec une version de base gratuite. Les salaires (AbaSalary) sont certifiés Swissdec.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    86Très biendès CHF 0 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBill✓ Oui
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Banana Buchhaltung

    Logiciel de comptabilité tessinois avec utilisation de type tableur, avec version gratuite.

    Idéal pour : Indépendants, start-up, petites entreprises et associations

    71Biendès CHF 0 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • CashCtrl

    Comptabilité cloud suisse, développée et exploitée en Suisse selon le fournisseur. Avec une version d'entrée gratuite et permanente.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    71Biendès CHF 0 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✕ Non
    Détails
  • Pfeffersack

    Comptabilité pour indépendants, raisons individuelles et petites Sàrl de la région bâloise. Données et justificatifs stockés en Suisse.

    Idéal pour : Indépendants et petites entreprises

    71Biendès CHF 60 / an
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en françaisÀ demander au fournisseur
    Détails
  • SoloDesk

    Logiciel de bureau suisse pour indépendants avec comptabilité et factures.

    Idéal pour : Indépendants

    71Biendès CHF 0 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suissesÀ demander au fournisseur
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Topal

    Logiciel suisse de comptabilité financière et de salaires (Topal Payroll, certifié Swissdec).

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    71BienLocation ou licence, prix dans les listes de prix (PDF) du fournisseur
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Crésus

    Comptabilité, facturation et salaires. Crésus Salaires est certifié Swissdec.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    57Satisfaisantdès CHF 15 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBill✓ Oui
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • MILKEE

    Logiciel de comptabilité suisse pour indépendants et petites Sàrl.

    Idéal pour : Indépendants et petites entreprises

    57Satisfaisantdès CHF 24.90 / mois
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en françaisÀ demander au fournisseur
    Détails
  • Accounto

    Logiciel suisse de comptabilité et de salaires. Les déclarations de salaire sont certifiées Swissdec.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    43SuffisantFrais mensuels par entreprise, prix sur demande
    Décompte TVAÀ demander au fournisseur
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • CustomerCore

    Logiciel de gestion pour PME avec gestion clients et comptabilité, hébergé en Suisse.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    43Suffisantdès CHF 39 / mois
    Décompte TVAÀ demander au fournisseur
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en françaisÀ demander au fournisseur
    Détails
  • Exxas

    Logiciel de gestion suisse avec gestion clients, factures et comptabilité.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    43Suffisantdès CHF 19 / mois
    Décompte TVAÀ demander au fournisseur
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suissesÀ demander au fournisseur
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • mySORBA

    Logiciel de gestion suisse avec comptabilité et salaires (mySORBA.Lohn, certifié Swissdec).

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    43SuffisantPrix selon forfait et utilisateurs, offre auprès du fournisseur
    Décompte TVAÀ demander au fournisseur
    QR-facture✓ Oui
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suissesÀ demander au fournisseur
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • PiNUS21

    Logiciel comptable suisse, hébergé en Suisse. Pinus Lohn est certifié Swissdec.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    43SuffisantAbonnement annuel, prix dans le configurateur du fournisseur
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suissesÀ demander au fournisseur
    Données en Suisse✓ Oui
    Accès fiduciaire✓ Oui
    Disponible en françaisÀ demander au fournisseur
    Détails
  • SelectLine

    Logiciel de gestion modulaire avec comptabilité, commandes et salaires. SelectLine Lohn est certifié Swissdec.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    29FaiblePrix non publié, sur demande auprès du fournisseur
    Décompte TVA✓ Oui
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suissesÀ demander au fournisseur
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Winbiz

    Logiciel de gestion avec comptabilité, facturation et salaires, aussi en version cloud. Salaires certifiés Swissdec.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    29Faibledès CHF 64 / mois
    Décompte TVAÀ demander au fournisseur
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • AdmiCash

    Programme comptable suisse avec modules débiteurs et créanciers.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    14FaiblePrix non publié, sur demande auprès du fournisseur
    Décompte TVAÀ demander au fournisseur
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suissesÀ demander au fournisseur
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en français✓ Oui
    Détails
  • Proffix Px5

    Logiciel de gestion suisse pour PME avec comptabilité, salaires, gestion des commandes et saisie du temps. Salaires certifiés Swissdec «plus».

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    14Faibledès CHF 62.10 / mois
    Décompte TVAÀ demander au fournisseur
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suisses✓ Oui
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en françaisÀ demander au fournisseur
    Détails
  • Infoniqa ONE 50 (früher Sage 50)

    Logiciel de comptabilité pour PME, anciennement Sage 50. Infoniqa a repris les activités suisses de Sage.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    0FaiblePrix non publié, sur demande auprès du fournisseur
    Décompte TVAÀ demander au fournisseur
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suissesÀ demander au fournisseur
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en françaisÀ demander au fournisseur
    Détails
  • Odoo

    Logiciel de gestion open source modulaire venu de Belgique, avec comptabilité, CRM et bien plus. Les salaires suisses sont certifiés Swissdec.

    Idéal pour : À demander au fournisseur

    0FaiblePrix sur odoo.com, non indiqués en CHF
    Décompte TVAÀ demander au fournisseur
    QR-factureÀ demander au fournisseur
    eBillÀ demander au fournisseur
    Connexion banques suissesÀ demander au fournisseur
    Données en SuisseÀ demander au fournisseur
    Accès fiduciaireÀ demander au fournisseur
    Disponible en françaisÀ demander au fournisseur
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Guides

Questions fréquentes : Comptabilité

Dois-je tenir une comptabilité en tant qu'indépendant ?

Oui, mais pas toujours en partie double. SA, Sàrl et autres personnes morales doivent toujours tenir une comptabilité en partie double. Les entreprises individuelles et sociétés de personnes avec moins de CHF 500 000 de chiffre d'affaires lors du dernier exercice peuvent tenir une comptabilité simplifiée des recettes, dépenses et du patrimoine (art. 957 CO).

Combien de temps dois-je conserver les justificatifs ?

10 ans à compter de la fin de l'exercice (art. 958f CO). Les justificatifs peuvent être conservés sous forme électronique s'ils restent lisibles en tout temps. De nombreux logiciels proposent une archive à cet effet.

À partir de quand dois-je décompter la TVA ?

Dès que votre chiffre d'affaires annuel atteint CHF 100 000 (art. 10 LTVA). C'est le chiffre d'affaires mondial des prestations imposables qui compte. En dessous, l'assujettissement volontaire est possible. Si vous êtes assujetti, votre logiciel devrait établir directement le décompte TVA.

Combien coûte un logiciel de comptabilité ?

Les solutions cloud fonctionnent généralement par abonnement mensuel selon les fonctions choisies. Attention aux coûts supplémentaires : module salaires, connexion bancaire, utilisateurs supplémentaires ou accès fiduciaire. Les prix figurent dans notre comparatif ci-dessus.

Ai-je besoin de la QR-facture et d'eBill ?

La QR-facture est la norme pour les bulletins de versement en Suisse depuis octobre 2022. Un logiciel de comptabilité pour PME suisses doit donc pouvoir la créer. eBill est facultatif, mais utile si vous avez beaucoup de clients privés. Plus de 4 millions de personnes utilisent eBill.

Information générale, pas de conseil juridique. État : octobre 2026. · Dernière mise à jour: 10.2026Sources : textes de loi et autorités